因臭氧技术自身具备食品杀菌功能以及使用中的无残留性和安全性，由此突显出了其应用在食品工业中的环保性、适用性和方便性，所以它在很多领域行业中都得到了应用。例如，食品生产中，生产车间物体表面以及空气的消毒和杀菌、冷库消毒、果蔬保鲜保存、工作服和生产用具的消毒、饮用水和生产用水净化消毒等。臭氧对饮用水的消毒近几年，随着对臭氧技术在饮用水处理方面的广泛应用，使得该技术应用市场规模不断扩大。国内的水厂，基本上已经实现了对臭氧技术的广泛应用，也就是利用活性炭加臭氧通过工艺改造实现饮用水处理的工艺。在生产瓶装水的过程中，臭氧主要被用来消毒直饮水，这项技术相对成熟。臭氧和紫外线在消毒功能上相比，其的应用优势更大。另外，臭氧水的浓度越高，其杀菌功能越明显，可以实现加盖过程、瓶盖、瓶体的同时消毒，而紫外线要想到达此要求就比较困难。从目前看，利用臭氧进行消毒已经成为了瓶装水生产过程中的标准工艺。国家疾病预防控制中心有明确规定:对外销售的瓶装饮水水都要应用臭氧做消毒处理。臭氧对食品加工过程的杀菌消毒臭氧技术除了能对封闭空间做杀菌消毒外，对物体内部和表面也能起到相应的作用，近年来，臭氧技术的应用能力已得到了深入开发，食品工业对其也越来越重视起来。因臭氧在灭杀酵母菌时比较容易，由此突出了其在包装处理过程中的作用。近年来，随着酒精剂封入包装、脱氧剂封入包装、真空包装和置换包装的迅速普及，包装食品衍生出了新的变质问题: 那就是酵母菌所引发的变质。所以在包装食品时，要注意填充臭氧，通过此对酵母菌进行灭杀。与其他消毒杀菌方法相比，臭氧具有特殊作用，主要表现在生产固体食品时，臭氧能够解决因细菌引发的二次污染。所以，在豆腐、咸菜、豆沙、包子和面条等食品生产过程中，通常会利用臭氧来对生产车间进行杀菌，将臭氧注入包装内进行杀菌以及利用臭氧水对原料进行冲洗，这些已成为保证包装食品安全的重要手段。在生产果汁、汽水和矿泉水等灌装水过程中，自然也会利用臭氧对塑料桶、玻璃瓶、设备、管理以及盛装容器进行杀菌消毒，而这方面也取得了一定成效。